PCR荧光分析显微镜是由激发滤光片，二向色镜以及发射滤光片组成的光学仪器，通常被设计来匹配特定荧光团或荧光蛋白的光谱。同时滤光片也可能会安装在一个转轮（称为滤光片转盘）上组成一个多通道滤波片组合。
滤光片轮盘您可以混合搭配，尽可能匹配我们所需要的激发和发射波长。最终的作用是是捕获到希望从结合靶标的荧光基团光束上捕获的光信号，同时尽可能屏蔽其它部分的任何光线（环境光，激发光源等）干扰。
PCR荧光成像使用的滤光片有哪些类型呢？
通常情况下，滤光片组被设计成可用于捕获制定荧光团的最大激发和发射波长，但不会捕获所有的荧光。
多数现代化滤光片组的设计旨在确保激发滤光片允许制定波长区间的光线通过。这种类型的滤光片称为带通滤光片。
带通滤光片通常通过中间波长和区间宽度确定。在较为简单的荧光显微镜装置中，一旦激发光线离开激发滤光片，即会照射到靶标上，靶标上的荧光激团随即变为激发状态，然后发射向光谱的红外端（相对于激发光线）迁移的光线，并非所有此类发射光线都会被检测器捕获到——仅哪些允许通过二向色镜且能通过发射滤光片的光线。
发射滤光片通常为带通滤光片或者长波通滤光片，具体取决于特定的荧光团和成像实验。如果您希望让超过特定波长的光线通过检测器，可选择长波通滤光片。
一款好的PCR荧光分析通道滤光片在临床诊断上仪器的稳定性和检测准确性、检測灵度当然是首选的指标，在科研上荧光定量PCR其意义在于对后续研究的指导性，数据越准确，对后续研究的指导性就越高。结果偏差越大的仪器反而会误导用户。
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